Calibrate…
เป็นการตั้งค่าการปรับภาพให้อยู่ในความหนาแน่นปกติ ไม่สามารถใช้ได้กับภาพแบบ 32-bit (อาจจะส่งผลให้ค่าความหนาแน่นของภาพแบบ 32-bit จะถูกปรับให้ลดลงจากเดิม)
การ Calibrate มีขั้นตอนการทำงาน 3 ขั้นตอน
1. ใช้ Analyze->Clear Results ยกเลิกการวัดแบบ counter และใช้เครื่องมือ Area Selection และ Analyse->Measure…[m] สำหรับบันทึกค่ามัธยฐานระดับเทา ของค่ามาตรฐาน
2. เมื่อสิ้นสุดการวัด เลือก Analyzed->Calibrate... เพื่อแสดงค่า Calibrate... หากต้องการ Calibrate ให้กำหนดค่ามาตรฐานที่รู้จักลงไปช่องขวา ส่วนช่องด้านซ้ายจะแสดงค่ามัธยฐานระดับเทา เลือกส่วนโค้งที่พอดีกับจาก popup menu กำหนดหน่วยการวัด คลิกปุ่ม OK ถ้าเลือก Show plot ด้วย โปรแกรม ImageJ จะแสดงการ calibrate แยกเป็นอีกหนึ่งหน้าต่าง หมายเหตุทั้งสองคอลัมน์จะต้องเป็นค่าตัวเลขที่เหมือนกัน
3. ถ้าค่าการ calibrate ไม่พอใจ กลับมาที่หน้า Calibrate... อีกครั้งแล้วเลือกค่าส่วนโค้งให้แตกต่างไปจากฟังก์ชันเดิมที่เคยใช้งาน
การเลือกฟังก์ชันสามารถเลือกจากเมนู drop-down (อธิบายเพิ่มเติมไว้ใน Curve-Filter’s built-in fuction)
Uncalibrated OD อ้างถึง Gels->Gel Analyser Optios…, เพราะ ImageJ แปลงระดับเาจาก 8-bit เป็น uncalibrated โดยใช้ฟังก์ชัน Unc. OD = log10(255/Pixel value) ใช้ได้กับภาพแบบ 8-bit เท่านั้น
Pixel Inverter ฟังก์ชันเส้นตรงกำหนดด้วย Inerted pixel = Bit-depth-1-Pixel ด้วยค่า Bit-depth เป็น 255 สำหรับภาพ 8-bit หรือ 65535 สำหรับภาพแบบ 16-bit
ตัวอย่าง
1. เปิดภาพ พร้อมสร้าง selection
2. เรียกใช้เมนู Analyze->Measure...
3. เลือกเที่เมนู Analyze->Calibrate...
4. กำหนดค่า
5. แสดงผลการวิเคราะห์
ไม่มีความคิดเห็น:
แสดงความคิดเห็น