วันเสาร์ที่ 30 เมษายน พ.ศ. 2559

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 85] Lookup Tables, ตัวอย่างการ Apply LUT แบบต่าง ๆ

ตัวอย่าง

ภาพ 8-บิต

ภาพเริ่มต้นแบบ 8-บิต


ภาพแบบ LUT = Cool

ภาพแบบ LUT = Cyan Hot

ภาพแบบ LUT = Gem

ภาพ LUT = Green Fire Blue

ภาพแบบ LUT = Thal

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 84] Lookup Tables, Apply LUT เครื่องมือการตั้งค่าของ lookup tables

Apply LUT

ปรับค่าสีของภาพหรือส่วนที่เลือกด้วย lookup table คำสั่งกลุ่มนี้มีการทำงานคล้ายกับ Image->Adjust->Brightness/Contrast...[C] สำหรับค่า thresholded นั้นเท่ากับกาปรับค่าใน Image->Adjust->Threshold...[T]

ตัวอย่างภาพ
ต้องกำหนดค่าใน Image->Adjust->Brightness/Contrast...
หรือ Image->Adjust->Threshold
ก่อนทำการใช้เมนู



การเลือกเมนู





ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 83] Lookup Tables, Invert LUT เครื่องมือการ invert LUT

Lookup Tables

จะมีเมนูย่อยที่่เกี่ยวกับค่า lookup table ที่ได้ติดตั้งเอาไว้ (ImageJ/luts/directory) ซึ่งสามารถปรับค่าให้ภาพเป็นสีเทาได้เป็นต้น มี lookup table หลายร้อยแบบที่ให้บริการที่เว็บไซต์ของ ImageJ มีทั้งบริการดาวน์โหลดแบบแยกไฟล์ หรือ แบบรวม zip ไฟล์ก็มี

Invert LUT

เป็นการทำตรงข้ามกับ lookup table ปัจจุบัน สำหรับภาพแบบ 8-บิต สมาชิกค่าสีแต่ละตัวจะแทนที่ด้วยค่าที่อยู่ในช่วง 255-ค่าสีที่ต้องการแปลง (ค่า 0 จะเป็นสีขาว และ 255 เป็น สีดำ) ต้องระวังคำสั่งนี้ไม่มีการแจ้งเตือน แต่จะเปลี่ยนแปลงค่าในภาพและแสดงผลเลย

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์



เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 82] Zoom, Overlay Options... เครื่องมือการตั้งค่าของ Ovelay

Overlay Options...

ใช้คำสั่งนี้สำหรับการกำหนด เส้นขอบ ความหนา และ สีที่เติมสามารถใช้งานร่วมกับ Edit->Selection->Properties...[y] และ Image->Overlay->Add Selection...[b] ค่าขอบจะถูกยกเลิกหาก ค่า Fill color ถูกกำหนดค่า หาก Width กำหนดเป็น0 จะแสดงเส้นขอบเป็นค่า 1 pixel

สีสามารถกำหนดเป็นค่าสีพื้นฐาน black blue cyan green magenta orange red white yellow หรือใช้รหัสสีฐาน16 ก็ได้ #000  #fff เป็นต้น

ภาพแบบ stack และ hyperstack ถ้าเลือกตัวเลือก Set stack positions จะทำให้ Overlay แสดงเฉพาะลำดับนั้น ถ้าไม่เลือกจะแสดงทุกส่วนของ stack

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



การตั้งค่า



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 81] Zoom, Label เครื่องมือการสร้าง Label บนภาพ Overlay

Labels...

เป็นการสร้าง Overlay ที่เป็น Label

ต้องสร้าง Overlay ก่อน Image->Overlay->Add Selection...[b] ตามด้วย Analyze->Measure...[m] ตามด้วย Analyze->Analyze Partices และ ROI Manager Show All

Color  เลือกสีของ Label
Font size กำหนดขนาดตัวอักษร (12-72pt)
Show labels ถ้าต้องการตกแต่ง Overlay ด้วยตัวอักษร
Use names as labels ถ้าเลือกตัวเลือกนี้ ROI names จะถูกแทนที่ตัวเลข ถ้าไม่เลือกจะเป็นขนาดของส่วนที่เลือกแสดง สามารถเปลี่ยนชื่อได้ด้วย Edit->Selection->Properties...[y] ถ้าใช้ ROI Manager สามารถใช้การ Rename... หรือ Properties... ได้
Draw backgrounds ถ้าเลือก ข้อความจะแสดง
Bold ถ้าเลือก Overlay จะมีความหนาขึ้น


ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



การตั้งค่า



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 80] Zoom, Flatten เครื่องมือการสร้างภาพภาพใหม่จากภาพ Overlay

Flatten [F]

เป็นการสร้างภาพ RGB ใหม่ ซึ่งมีส่วนประกอบของส่วน Overlay ด้วย ภาพที่ได้นี้จะมีนาดเท่ากับกับภาพที่ถูกเลือกแก้ไข ไม่เหมือนคำสั่ง Plugins->Utilities->Capture Image เพียงแต่จะสร้างภาพตามสิ่งที่เห็นในหน้าต่างนั้น WYSIWYG (What You See Is What You Get) ถ้าเป็นภาพแบบ stack จะต้องแปลงให้เป็น RGB (Image->Type->submenu)


ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 79] Zoom,List Elements เครื่องมือการดูรายละเอียด Overlay ที่ถูกสร้าง

List Elements

เป็นเครื่องมือการแสดงข้อมูล  Overlay ว่ามีรายละเอียดจำนวนกี่อัน ประกอบด้วย เป็น Overlay ประเภทอะไร ตำแหน่งที่ไหน เป็นต้น

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 78] Zoom,Remove Overlay เครื่องมือการลบ Overlay

Remove Overlay

เป็นการลบแบบถาวรไม่สามารถกู้คืนได้

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์


วันศุกร์ที่ 29 เมษายน พ.ศ. 2559

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 77] Zoom,To ROI Manager เครื่องมือการเอาภาพ Overlay เข้าไปยัง ROI Manager

To ROI Manager

คัดลอกส่วนที่เลือกหรือภาพบริเวณที่เป็น Overlay ไปที่ ROI Manager ซึ่งสามารถแก้ไขตำแหน่ง ขนาด ได้ภายหลัง (ดูเพิ่มเติม ROI Manager) แต่ค่าเดิมที่ถูกเก็บไเอาไว้ที่ ROI Manager จะถูกลบออกไป

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์



เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 76] Zoom, From ROI manager เครื่องมือดึง Selection จาก ROI Manager

From ROI manager

สร้าง Overlay ใหม่บนเครื่องมือการเลือก

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 75] Zoom, Show Overlay เครื่องมือการแสดง Overlay

Show Overlay

แสดงภาพที่ถูกซ่อนเอาไว้จากเมนู Overy

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 74] Zoom, Hidden Overlay เครื่องมือการซ่อน Overlay

Hidden Overlay

โปรแกมจะหยุดแสดงภาพ

ตัวอย่างภาพ



การเลือกเมนู



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 73] Zoom, Add Image เครื่องมือการ ซ้อนทับภาพ

Add Image...

เป็นการรวมภาพสองภาพที่เปิดอยู่ โดยขนาดต้องไม่ใหญ่กว่าภาพหลัก การรวมกันสามารถกำหนดค่า Opacity (0-100%) การกำหนดค่า x,y ตำแหน่งของการเพิ่มภาพขึ้นอยู่กับตำแหน่งของ สี่เหลี่ยมที่เลือก (selection)

ตัวอย่างภาพ
จะต้องเปิดภาพอย่างน้อย 2 ภาพ ดังภาพตัวอย่าง



การเลือกเมนู



การตั้งค่า



ผลลัพธ์


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 72] Zoom, Overlay เครื่องมือการ Add Selection

Overlay

ในหัวข้อนี้จะเป็นหัวข้อเกี่ยวกับการทำงานกับคำสั่งที่ไม่ทำให้โครงสร้างของภาพเสียหาย ประกอบด้วยหลายสิ่งต่อไปนี้ arrows, lines, points, shapes และ ข้อความ

กด B (Add Selection...[b]) เพื่อเพิ่มการเลือก
กด Shift F (Fatten [F]) สำหรับสร้างภาพ

การสร้าง Overlay กำหนดให้เป็นฟอร์แมตภาพแบบ TIFF

Add Selection...[b]

สร้างเส้นการเลือกเช่นสี่เหลี่ยม บนภาพแล้วกด b เพื่อสร้าง Overlay หรือ กดปุ่ม Alt B จะมีหน้าต่างกำหนดการสร้าง selection ประกอบด้วย เส้นขอบ  สีพื้น โดยใช้สีพื้นฐาน black, blue cyan, green, magenta, orange, red, white, yellow หรือใช้รหัสสีแบบ Hexadecimal ก็ได้

การเพิ่ม Overlay ใหม่ และมีการเลือกตัวเลือก New overly การสร้าง Overlay ก่อนหน้าจะถูกลบออกไปแทนที่ด้วย Overlay ตัวใหม่ที่กำลังสร้าง




ตัวอย่างภาพ



สร้าง Selection วงกลมขึ้นมาก่อน


การเลือกเมนู



การตั้งค่า

กด Alt B เพื่อตั้งค่าเติมสีลงไป


ผลลัพธ์