ImageJ สามารถแสดงภาพหลายภาพในหน้าต่างเดียวกันได้ ด้วยการรวมกลุ่มภาพซ้อน ๆ กัน เอาไว้ โดยกลุ่มภาพที่ได้รวมกันนี้จะเรียกว่า Stack ภาพที่นำมาสร้าง Stack นั้นจะเรียกว่า Slice หลาย ๆ Slice รวมกันก็จะเป็น Stack นั้นเอง กลุ่ม Pixel ที่รวมกันในแบบ Stack นั้นจะเรียกว่า voxel (volumetric pixel) โดยจะรวมค่า ความสว่าง และค่าอื่น ๆ เอาไว้ด้วย
ทุก Slice ที่จะนำมาสร้าง Stack นั้นจะต้องมีขนาดที่เท่ากัน ค่า bit depth ที่เท่ากันด้วย ส่วนของ Scrollbar ที่อยู่ด้านล่างของหน้าต่าง Stack นั้นสามารถใช้เลื่อนแสดงภาพแทนปุ่ม Start ได้ หากต้องการตั้งค่าการเล่นภาพแบบเคลื่อนไหว สามารถคลิกขวาที่ปุ่ม Play หรือ Pause ได้
การกำหนดตัวกรองภาพก่อนการเปิดภาพขึ้นมาแบบ Stack มีหลายรูปแบบด้วยกัน และหากต้องการเปิดภาพแบบที่มีคุณภาพของภาพแบบไม่บีบอัดสามารถเปิดภาพได้จากเมนู File->Import->Raw แต่หากมี Folder รูปภาพและต้องการเปิดภาพจาก Folder นั้นก็สามารถทได้ด้วยการเลือกภาพแบบเรียงลำดับตามจำนวนภาพใน Folder หรือ กำหนดเองได้ โดยใช้เมนู File->Import->Raw ก็ได้ นอกจากการนำเข้าภาพมาเป็น Stack แล้วยังสามรถเพิ่มและลดภาพได้ในภายหลังจากที่ได้เพิ่มเข้ามาในตอนแรกได้ด้วย
นี้นับว่าเป็นส่วนหนึ่งของการกำหนดให้โปรแกรมสามารถแสดงผล เพื่อให้เราสามารถวิวดูตัวอย่างภาพก่อนจะประมวลผลในขั้นตอนอื่น ๆ ต่อไปอีกได้
|
ขั้นตอนการเพิ่มไฟล์ เพื่อนำมาสร้างเป็น Stack สำหรับการประมวลผลภาพหมู่ |
|
หน้าต่างนี้สำหรับกำหนดจำนวนภาพใน folder เพื่อกำหนดจำนวนภาพใน folder เพื่อเข้ามาสร้างเป็นภาพหมู่ โดยมีตัวเลือกให้ลองเลือกใช้งานอีกหลายตัวเลือก |
|
เมือกดปุ่ม OK จากภาพด้านบน โปรแกรมก็จะสร้าง Stack ให้แต่ออาจจะมองเห็นแค่ภาพเดียว สามารถกดปุ่ม Play หรือ Scrollbar สำหรับเลื่อนดูภาพต่อไปได้ |
|
นี้เป็นตัวอย่างการจัดเรียงภาพแบบให้ทุก Slice แสดงผลอยู่ในหน้าต่างเดียวกัน |
|
ตัวอย่างการแสดงภาพแบบ Montage.... |
|
ยังสามารถแสดงกราฟดูค่า mean ค่า Max ค่า Min ได้ด้วย มีทั้งกราฟและตัวเลข |
|
ตัวอย่างนี้เป้นตัวอย่างการรวมทุกภาพใน Stack มาเป็นภาพเดียวกัน ด้วยความสามารถก็จะได้ที่รวมทุกภาพเข้าไว้ด้วยกันออกมาตามตัวอย่างนี้เลยครับ |
Virtual Stacksเป็นส่วนที่อยู่บนดิส ทำหน้าที่ตรงข้ามกับการทำงานของ Ram และ Virtual Stack เป็นเพียงทางเดียวที่จะโหลดภาพ แบบเป็นลำดับที่ไม่สามารถจัดเก็บลง Ram ได้ การใช้งาน Virtual Stack นั้นมีข้อกำหนดที่ควรจดจำเมื่อจำเป็นต้องใช้งาน ดังนี้
- Virtual Stack สามารถอ่านได้เพียงอย่างเดียว เพราะฉะนั้นการเปลี่ยนแปลงส่วนใดของ Slice จะไม่สามารถจัดเก็บได้ เมื่อเปลี่ยน Slice ในการทำงาน แต่สามารถใช้ Macro ช่วนในการทำงานได้ โดยไปที่เมนู Process->Batch->Virtual Stack...
- หากใช้คำสั่ง Image->Crop โปรแกรมอาจจะเกิด Out of Memory ได้ เพราะ Stack จะถูกสร้างขึ้นเรื่อย ๆ แต่ Virtual ไม่ได้ถุกสร้างตาม มีเพียงเท่าเดิม
Stack เมื่อต้องทำงานร่วมกับ Hyperstacks สามารถเรียกใช้ผ่านเมนู File->Open Sample->Mitosis ... จำนวนมิติของ Hyperstacks สามารถลดลงได้ด้วยคำสั่ง Image->Hyperstacks->Reduce Dimensionality หรือ Image . Stacks . Z Project. . . หรือ Image .Hyperstacks . Channels Tool... ตัวอักษร (V) ที่อยู่ในหน้าต่าง จะหมายถึง Virtual image (Virtual Stack)
- ไฟล์รูปแบบ TIFF จะสามารถทำงานได้เร็วกว่า ไฟล์รูปแบบ JPEG แต่ก็สามารถแปลงจาก JPEG เป็น TIFF ได้ด้วยการ File->Save as ->Image Sequence ...
Hyperstacksเป้นการเก็บข้อมูลภาพในหลายมิติ เป็นส่วนเพิ่มเติมจากการทำงานแบบ Stack จะมีจำนวนมิติเป็น 4D หรืแ 5D เช่น ความกว้าง (x) ความยาว (y) จำนวนแบรน (c) และค่า time frame (f) หน้าต่างของ Hyperstack จะเป็นหน้าต่างคล้ายกับ Virtual Stack เข่น Scrollbar ส่วนค่า f นั้นจะเป็นปุ่มที่อยู่กับการเล่นและหยุดของ Hyperstacks
|
ส่วนของการทำงานของ Hyperstacks |