วันศุกร์ที่ 8 เมษายน พ.ศ. 2559

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 12] Color เครื่องมือจัดการภาพสี การรวมช่องสัญญาณ Color Merge Channels

การ Merge Channels...


เมนู Image->Color->Merge Channels...


สำหรับการรวมภาพ 2-7 ภาพเป็นภาพ RGB เพียงภาพเดียว หรือ รวม multi-channel เป็น 1 ภาพ เลือกภาพตั้งแต่ C1-C7 จากหน้าต่างการทำงาน เลือก *None* เพื่อข้ามช่องทางนั้น



Create composite ถ้าเลือกตัวเลือกนี้จะสร้าง Composite Image ถ้าไม่เลือกจะสร้างภาพแบบ RGB เมื่อมีการสร้างภาพแบบ Composite ตาราง LUTs จะถูกป้องกันเอาไว้จนกว่าจเลือก Ignore source LUTs แต่สร้างภาพ RGB ตาราง LUTs จะถูกยกเลอกอัตโนมัติ

Keep source Image ถ้าเลือกภาพต้นฉบับจะไม่ถูกเปลี่ยนแปลง

Ignore source LUTs ถ้าเลือก LUTs ของภาพต้นฉบับจะถูกเพิกเฉยไม่มีผลกระทบต่อการแก้ไข ในกรณีของการ merged ภาพ RGB จะมีการสร้าง LUTs แบบเสมือนขึ้นมา

ตัวอย่าง

สมมติมีภาพ RGB และ Gray scale ที่ได้จากการ Split Channel แล้วดังภาพ

Channel blue

Channel green

Channel red

เมื่อใช้คำสั่ง

 Image->Color->Merge Channels...

ภาพจะรวมกันได้ดังภาพด้านล่าง ซึ่งเกิดเป็นผลลัพธ์ภาพใหม่



เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 11] Color เครื่องมือจัดการภาพสี การแยกช่องสัญญาณ Color Split Channels

Color

เมนูย่อยของ Color เป็นคำสั่งที่มีผลต่อการทำงานของภาพสี ประกอบด้วย

1. Split Channels

เลืกจากเมนู Image->Color->Split Channels  จะเป็นการแยกภาพออกเป็นภาพระดับเทา 8-บิต และ 3 องค์ประกอบ คือ red, green, blue  ยกตัวอย่างการเปิดภาพ File->open Sample>Organ of Corti Z2.8M, 4D) หน้าต่างทีแยกออกมาตรง Title bar จะตามด้วยชื่อ (red), (green), (blue) (ImageJ 1.46r) สำหรับเวอร์ชั่น 1.49v จะเป็น C1=red, C2=green, C3=blue, C4=grayscale


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 10] กำหนดคุณสมบัติของภาพด้วย เมนู Properties...[P]

Properties...


ใช้คำสั่งนี้สำหรับการตั้งค่าคุณสมบัติต่าง ๆ ของภาพปัจจุบันที่ถูกเลือก

จำนวน Chanels (c), Slice (z) และ Frames (t) ของภาพสามารถแปลงให้อยู่ในรูปของผลลัพธ์ของ c, z และ t ได้ โดย  t เป็นค่าจำนวนภาพที่อยู่ในสแต๊ก

Unit of Length เป็นข้อความอธิบายหน่วยการวัดของ ค่า Pixel Width, Pixel  Height, Voxel depth ค่าดังกล่าวจะแปลงอัตโนมัติตามหน่วยในช่อง Unit of Length ตามหน่วยที่ ImageJ รู้จัก ประกอบด้วย
'nm', ('um ' หรือ 'micron'), 'mm', 'cm', 'meter', 'km' , 'inc' ตัวอักษรชนิดของหน่วย สามารถพิมพ์จากตัวคีย์ลัด เพื่อให้เป็นตัวอักษรหน่วยที่ถูกต้อง ได้เช่น Alt+M และ Alt+Shif+A  ลองทดสอบพิมพ์ดูเพื่อดูาพ

ค่า Frame Interval กำหนดระยะเวลาแสดงภาพ (สัมพันธ์กับ t-series)  สามารถกำหนดระเวลาในการแสดงผลได้

Origin จะอ้างอิงกับจุด 0,0 (ในหน่วย Pixel) ของภาพ

Global เป็นการสร้างการตั้งนี้ให้มีผลต่อภาพทุกภาพที่อยู่ช่วงระยะเวลาการทำงานเดียวกัน

วันจันทร์ที่ 28 มีนาคม พ.ศ. 2559

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 9] แสดงรายละเอียดของภาพด้วย เมนู Show Info

Show Info... [i]


หน้าต่าง Show Info ประกอบไปด้วยข้อมูลเกี่ยวกับภาพปัจจุบันที่เรียกใช้เมนู มีรายละเอียดต่าง ๆ ประกอบด้วย ข้อมูล pixel หรือ voxel size มีมาตั้งแต่ IJ 1.44 สำหรับภาพแบบ DICOM และ TIFF ข้อมูลภาพจะประกอบด้วยรายละเอียดของ header สามารถบันทึกข้อมูลเหล่านี้เป็นไฟล์หรือบันทึกเอาไว้ที่หน่วยความจำของระบบได้ ด้วยกาคลิกขวา เลือก save as เพื่อบันทึกเป็น text file หรือ เลือก copy เพื่อเก็บเอาไว้ที่หน่วยความจำของระบบบก็ได้


เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 8], Adjust กำหนดขนาดของเส้น สำหรับเคื่องมือ Line Selection

Line Width...


เครื่องมือนี้ใช้ในการปรับค่าความกว้างของเส้นที่เลือก (ในหน่วย pixel)  วิธีการเปิดที่ง่าย สามารถทำได้ด้วยการ ดับเบิลคลิก (double click) บนเครื่องมือ Line Selection

ภาพประกอบจาก imagej

วันศุกร์ที่ 25 มีนาคม พ.ศ. 2559

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 7], Adjust การปรับขนาดภาพด้วยการก Canvas size เพื่อเพิ่มพื้นที่ให้กับภาพ

Canvas Size...


เปลี่ยนขนาดของภาพ แบบไม่เปลี่ยนแปลงขนาดภาพต้นแบบ คือการเพิ่ม Width หรือ Height แบบไม่มีผลกระทบต่อขนาดเดิม เป็นลักษณะการเพิ่มขอบ ต่อเติมออกไ โดยสามารถกำหนดได้ว่าจะให้เพิ่มที่ตำแหน่งใด โดยการเลือกที่ตัวเลือก Position ดังภาพประกอบ




Zero Fill ถ้ามีการเลือกที่ตัวเลือกนี้ บริเวณที่เพิ่มขึ้นมาใหม่จะถูกกำหนดว่าให้มีค่าเป็น ศูนย์ (0)

เมนู Image with ImageJ [ตอนที่ 6], Adjust การปรับขนาดภาพ ด้วย เครื่อง Size ใน ImageJ

Size...

เป็นการกำหนดการวัดขนาดของภาพ หรือ ส่วนที่เลือกตามค่า Width และ Height ในหน่วย pixels




Check aspect ration หากมีการเลือก จะเป็นการปรับค่า Height หรือ Width ตามสัดส่วนที่เหมาะสม

Average when downsizing เป็นตัวเลือกเพื่อประสิทธิภาพในการย่อ-ขยายภาพ ที่ดีขึ้นโดยมีให้เลือก 2 อัลกริทึม คือ Bilinear และ Bicubic