ใช้หน้าต่างนี้สำหรับควบคุมการแสดงผลแบบกราฟ ซึ่งการแสดงผลแบบกราฟนี้สามารถเรียกใช้ได้จากเมนู
Image->Stacks->Plot Z-axis Profile...,
Analyze->Plot Profile [k],
Analyze->Calibrate...,
Analyze->Tools->Curve Fitting...,
โดยมีรายละเอียอดสำหรับการตั้งค่าดังนี้
Plot Width and Plot Height กำหนดความยาว (ในหน่วย พิกเซล) ของแนวแกน X หรือความกว้าง และ แนวแกน Y ความสูงของกราฟ
Fixed y-axis Scale ถ้ามีการเลือก ตัวเลือกนี้ ค่าแนวแกน Y จะถูกกำหนดแบบค่าคงที่ และจะใช้ค่าจากช่อง Minimum Y และ Maximum Y หากมีการกำหนดค่าเป็นแบบอื่น ค่าจะถูกกำหนดบนพื้นฐานของค่าระดับเทาของ minimum and maximum
Do not Save z-values ถ้าหากมีการกำนดค่าตัวเลือกนี้ รายการเมนู 'List', s'Save...' และ 'Copy...' จะแสดงปุ่มในข้อมูลของกราฟที่แสดงผลด้วย
Auto-close หากมีการเลือกตัวเลือกนี้เอาไว้ ข้อมูลของหน้าต่างกราฟ จะปิดอัตโนมัติ เมือมีการคลิกเลือก 'List', 'Save', 'Copy'
Vertical Profile หากมีการเลือกตัวเลือกนี้ (อธิบายเพิ่มเติม) จะเป็นการเปลี่ยนแปลงค่าแถวเฉลี่ยของพื้นที่เลือกเอาไว้ สี่เหลี่ยม หรือ แบบเส้นที่มีความกว้างมากกว่า 1 แทนค่าเดิมที่ได้คำนวณเอาไว้แล้ว
List values ถ้ามีการเลือก ค่า list จะมีการเปิดอัตโนมัติ หากมีการเลือก Auto-close เอาไว้ด้วยค่านี้ก็จะถูกเปิดค้างเอาไว้โดยไม่ปิดอัตโนมัติ
Interpolate line profiles ถ้าหากมีการเลือกเอาไว้ เมื่อมีการใช้คำสั่ง Analyze->Plot Profile [k] จะมีการเรียกใช้อัลกอริทึม bilinear เมื่อมีการเรียกคืนค่าที่เกิดจากการเลือก
Draw grid lines ถ้ามีการเลือกจะแสดงเส้นตารางสีเทาขึ้นมาด้วย
Sub-pixel resolution หากมีการเช็ค การเลือกด้วยเส้น ในขณะที่ซูมภาพ จะใช้ค่า floating-point ในการระบุจุดบนภาพ
Help เปิดตัวช่วยเหลือจาก เว็บเพจ http://imagej.nih.gov/ij/docs/menus/edit.html#plot-options
